1. Авторизуйтесь на Яндексе и добавьте сайт в список ваших сайтов на странице «Мои сайты». По умолчанию статус добавленного сайта будет «Не подтвержден».
2. Выберите способ подтверждения прав собственности -  «Мета-тэг».
3. Из предложенного ниже мета тега, скопируйте текст, который идет за словом «content=»
4. В панели управления магазином, перейдите в раздел:  «Настройки»→«Дизайн»→редактировать текущий→«Мета теги»→«Добавить метатег».
5. Выберите тип «Yandex», а в поле «Значение» вставьте скопированную часть мета тега и нажмите «Добавить».
6. Вернитесь на страницу «Подтверждение права собственности» и нажмите «Подтвердить».

Готово!

Приятной работы!